L'abbé Augustin Dusautoir dans son ouvrage de 1903 intitulé "Guide pratique du visiteur" nous apporte les précisions suivantes :

Descendez maintenant du parvis du côté gauche et commencez l'inspection du transept. Voici d'abord, sur le premier pilier à droite, un petit tableau sur bois représentant un Christ en croix. C’est une assez bonne copie réduite d’un tableau de Van Dyck. Au second pilier, une adoration des bergers, tableau sur toile du XVIII ème siècle. Entre ces deux piliers, la tradition fixe l'emplacement d'un puits dit de sainte Austreberthe et creusé à l'époque de saint Omer, il est aujourd'hui comblé. Sur le mur en hauteur 21 armoiries des évêques de Saint-Omer (seules, celles de Ladislas Jonnart ne sont pas représentées), peinture sur pierre. Il manque également les armoiries de Guillaume de Poitiers qui fut refusé.
Liste des 23 évêques de Saint-Omer
1559 à 1563, I. Guillaume de Poitiers, ( non sacré, exerça en toute illégalité ).
1563 à 1577, II. Gérard d'Haméricourt, ( en même temps Abbé de Saint-Bertin ).
1581 a 1586, III. Jean Six, ( lillois, sacré à Douai ).
1587 à 1590, IV. Jacques de Pamela, ou Pamelé, ( non sacré ).
1590 à 1599, V. Jean de Vernois.
1600 à 1618, VI. Jacques Blazoeus, ou Blaise, ( auparavant évêque de Namur ).
1618 à 1627, VII. Paul Boudot, ( puis évêque d'Arras ).
1628 à 1631, VIII. Pierre Paunet.
1632 à 1633, IX. Christophe de Morlet.
1634 à 1656, X. Christophe Defrance.
1661 à 1671, XI. Ladislas Jonart, ( puis archevêque de Cambrai en 1761 ).
1673 à 1675, XII. Jacques Théodore de Brias, ( puis archevêque de Cambrai ).
1676 à 1677, XIII. Charles de Longueval, ( non sacré ).
1677 à 1677, XIV. Pierre Vandenperre, ( nommé par le roi d'Espagne ).
1677 à 1684, XV. Arnoud-Aune Tristan de la Baume de Suze , ( non sacré ).
1684 à 1708, XVI. Louis-Alphonse de Valbelle, ( auparavant évêque d Aleth ).
1708 à 1737, XVII. François de Valbelle de Tourve, ( cousin du précédent ).
1737 à 1754, XVIII. Joseph-Alphonse- François de Valbelle, ( neveu du précédent).
1754 à 1765, XIX. François-Joseph de Brunes de Montlouet.
1766 à 1769, XX. Louis-François-Marc-Hilaire de Conzié, ( puis évêque d'Arras ).
1769 à 1774, XXI. Joachim-François Mamert de Conzié, ( puis évêque de Tours ).
1774 à 1778, XXII. Jean-Auguste de Chastenet de Puységur, ( puis évêque de Carcassonne ).
1778 à 1789, XXIII. Alexandre-Joseph-Marie-Alexis de Bruyères-Chalabre, ( émigré ).
Sur le mur à gauche, l'inscription commèmorative d'un chanoine et gradué en droit Jean-Baptiste Doresmieulx, ancien curé de Saint-Martin-au-Laërt, décédé en 1785. A côté d'elle, un joli Haut-relief, du XV ème siècle. Monté sur une colonne, il reproduit la· scène du baptême de Notre-Seigneur Jésus-Christ. Le chanoine décédé en 1450 est représenté sur le côté avec son patron . Scène sculptée dans le calcaire, avec polychromie et dorure. Cadre en calcaire taillé et sculpté, peint, polychrome, en forme d'accolade et deux pinacles et entablement. Baptême du Christ, saint Côme, saint Damien, homme : en donateur, Dieu le Père Date portée : 1450 (date du décès). Fiche AOA : Le nom du chanoine en prière dans ce relief, présenté par saint Jean l'Evangéliste, n'est plus lisible par l'épigraphie taillée en creux, mais on peut déduire de la présence à la droite du Christ, des saints Côme et Damien, identifiables à leurs bonnets et leurs attributs, l'urinal et le pot à onguents, que le donateur était pharmacien ou médecin, sans doute attaché, ainsi que le laisse entendre le texte lacunaire de l'épigraphie, au service des ducs Philippe le Bon et Charles le Téméraire. Ces indices permettraient de l'identifier au chanoine Candel, chirurgien de Philippe le Bon.

M. le chanoine Bum, ancien président de la Société des Antiquaires de la Morinie, a entrepris l'intéressante histoire des évêques Audomarois dont la générosité ne s'est pas bornée à doter la ville de Saint-Omer de riches et charitables fondations encore en partie à la disposition de l'administration civile des hospices au XX ème siècle, mais qui l'a de plus ornée de superbes édifices qui la constituaient autrefois en faisant une cité sans rivale, pour le nombre et la beauté de ses établissements religieux consacrés à la prière, à l'enseignement et à la charité. L'évêché de Saint-Omer comprenait un archiprêtré et huit doyennés, ceux d'Helfaut, d'Aire, de Lillers, d'Arques, de : Marcq-en-Calaisis, de Merville, de Bour­ bourg et de Cassel.
Au-dessous, se lit l'inscription funéraire du chanoine de Lauretan, ancien vicaire général, mort en 1778.
On remarque ensuite un très intéressant Haut-relief du XV ème siècle, dont la scène est abritée d'un joli dais à galerie ajourée. Haut-relief peint et doré surmonté d'un baldaquin en pierre ajouré. Sous l'inscription, deux culots sculptés et peints. Le saint représenté à dextre (diacre tenant une épée) serait saint Guillbert. Sainte Aldegonde porte une robe bleue et un voile blanc. La Vierge se tient à senestre, près de celui qui pourrait être saint Omer. II a pour sujet Jésus-Christ récussité, triomphant de la mort. L'inscription gothique est malheureusement fruste et illisible. On peut supposer que le chanoine défunt dont il s'agit ici est le donateur de l'un des rares vitraux de cette époque qui subsistent encore et qu'en vous retournant sur place vous apercevrez dans les verrières du transept, reproduisant le Sauveur sortant du tombeau et entouré des mêmes personnages qui figurent dans ce bas-relief.
Plus loin à droite nous arrivons dans l'emprise de l'ancienne chapelle saint Antoine, sur le mur occidental, on distingue les inscriptions funéraires d'Adrien de Carvin de Lillers archidiacre d'Artois et doyen du Chapitre décédé en 1773, de Jacques de Bryas, grand-chantre et également doyen du Chapitre mort en 1769 et de Joseph Baron d’Assignies, chanoine et receveur de la fabrique de l'église décédé en 1778.